EMI
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Responsabile: Gabriele Procaccini

Attività

Nel laboratorio di Ecologia Molecolare e Genomica Funzionale si portano avanti studi finalizzati a rispondere a domande ecologiche, con l’utilizzo di approcci di tipo molecolare. Il laboratorio copre attività di ricerca che vanno dalla filogenesi e tassonomia molecolare alla filogeografia e genetica di popolazione, tramite analisi di sequenza ed analisi di marcatori polimorfici, come microsatelliti e SNPs. Ci si occupa anche dello studio della funzione genica mediante approcci di genomica funzionale e genetica inversa (prevalentemente produzione di linee transgeniche di diatomea). Ci si avvale inoltre di analisi di trascrittomica e genomica ambientale e comparativa, e si realizzano studi di espressione genica in condizioni naturali e controllate (RNA-Seq, RT-qPCR ).

Sistema per la sperimentazione

  • Mesocosmi per mantenimento di organismi bentonici in condizioni controllate.
  • Camera walk-in per colture microalgali.

Analisi

  • Estrazione DNA, purificazione e quantificazione.
  • Estrazione RNA, purificazione, quantificazione e retrotrascrizione.
  • Estrazione di proteine e quantificazione.
  • Preparazione campioni per analisi di RT-qPCR in piastra.
  • Preparazione campioni per sequenziamento massivo.
  • Preparazione campioni per analisi di sequenza.
  • Preparazione campioni per analisi di frammenti.
  • PCR singole ed in multiplex.
  • Elettroforesi su gel di agarosio e di acrilammide.
  • Analisi statistiche di genetica di popolazione e filogenesi molecolare.
  • Disegno primers, analisi profili elettroferogrammi.
  • Clonaggi e trasformazione batterica.
  • Preparazione di DNA plasmidico (mini e maxi prep).
  • Trasformazione biolistica e produzione di colture transgeniche.
  • Colture algali.
  • Colorazioni con coloranti vitali fluorescenti ed analisi microscopica.
  • Southern blot, Northern blot.
  • Western blot e saggi enzimatici (colorimetrici, ELISA).
  • Utilizzo di software specialistici per l’analisi banche dati nucleotidiche e proteiche e per l’esplorazione di genomi.

Strumentazione

  • Strumentazione di base per la biologia molecolare (PCR, centrifughe, apparati elettroforetici, transilluminatore, bagni termostatici, spettrofotometro, fluorimetro, pH-metro, bilancia di precisione).
  • Gene gun (apparecchio per la trasformazione biolistica).
  • Cappe per colture algali.
  • Microscopi.
  • Mixer Mill (Tissue lyser).
  • PC e software per analisi molecolari.
  • Cappa chimica.
  • TurboGen (strumento per la generazione di turbolenza marina).

Villa Dohrn Ischia (Foto Iacono)L’Ischia Marine Centre (IMC) è un centro interdipartimentale che si occupa, attraverso un approccio integrato, di valutare la vulnerabilità degli ecosistemi e gli organismi marini che li abitano evidenziando le interazioni tra i fattori di stress derivati dalle attività antropiche e i cambiamenti climatici, e le azioni di protezione e restauro ambientale. Scopo della ricerca dell’IMC è facilitare ricerche in cooperazione, tra ricercatori interni ed esterni, promuovendo interdisciplinarità e relazioni con attori e stakeholder pubblici e privati.

Le principali linee di ricerca riguardano:

1) Ecologia del Benthos: studio degli effetti dei cambiamenti globali sulla biodiversità, sull’interazione piante-animali, sul microbioma associato alle specie marine.
2) Ecofisiologia e biotecnologie: studio morfo-funzionale delle comunità costiere associate a fanerogame marine ed ecologia chimica, anche mediante colture di organismi modello e per la produzione di biotecnologie.
3) Biologia della pesca: studio di uova e larve di pesci per capire le variazioni di abbondanza e distribuzione di popolamenti di pesci.
4) Tassonomia degli organismi marini: l’Unità di Tassonomia degli Organismi Marini (MOTax) all’IMC si concentra sull’analisi della componente bentonica (sorting, identificazione al LPT, analisi dei dati ecologici).

La sede è organizzata in tre strutture con due aree funzionali:

Villa Dohrn, sede storica, costruIschia 2ita nel 1906 come residenza privata della famiglia Dohrn e diventata nel 1969 Laboratorio di Ecologia del Benthos; attualmente oggetto di un importante intervento di ristrutturazione e rifunzionalizzazione, sarà il nuovo “Centro Ricerche Adattamento Ecosistemi Marini ai Cambiamenti Climatici”

MEDAS Centre (Marine Ecological Data Analysis and Synthesis) nato con l’obiettivo di analizzare le informazioni esistenti, dando risposte alle grandi domande ed esigenze anche economiche nell’ambito della BlueIschia 3 Growth, è oggi sede operativa dell’IMC e dell’Area Funzionale Ecologia del Benthos/Necton per tutto il Dipartimento EMI della SZN

Diving Centre, diving scientifico per il supporto delle attività di ricerche a mare, con Area Funzionale Diving Center Ischia, ubicato in prossimità dell’ormeggio dell’imbarcazione della SZN affidata all’Ischia Marine Centre: il Beagle Junior.

Coordinatore sede

Maria Cristina Vigo Majello
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+39 338 4926845
+39 081 5833401

Vigo Majello

Personale di sede

Coordinatore
Maria Cristina Vigo Majello

Amministrazione
Messina Rosanna
Patti Francesco

Primo ricercatore
Ciannelli Lorenzo
Teixidó Núria
Zupo Valerio

Ricercatore
Mazzella Valerio

Tecnologo
Lorenti Maurizio

Collaboratore Tecnico
Chiarore Antonia
Guglielmo Rosanna
Iacono Bruno
Mirasole Alice
Rando Vincenzo

Borse di Ricerca
Italiano Anna

PhD student
Liguori Gianluca
Nannini Matteo
Somma Emanuele

Lo staff di Villa Dohrn-ecologia del benthos  conduce ricerche a lungo termine su alcuni siti attorno all’isola d’Ischia che rappresentano stazioni pilota per monitoraggi continui ed integrati di specie, comunità ed ecosistemi marini che hanno peculiarità ed elevata valenza ecologica in quanto includono specie ed habitat protetti nell’ambito della Comunità Europea.

Sistemi a Posidonia oceanica di Lacco Ameno e del Castello Aragonese

Sono due sistemi a Posidonia oceanica - specie protetta in ambito Europeo, ed uno degli habitat di riferimento per la valutazione della qualità delle acque nell’ambito della Marine Strategy - che sono entrambe inseriti nella rete dei siti marini LTER-Italia ("Italian  long-term ecological research network"), e studiati per diversi aspetti ecologici da numerosi anni dallo staff di Villa Dohrn. Maggiori dettagli su questi siti e sul progetto LTER-Italia sono reperibili alla voce specifica di questo sito web e sul sito: http://www.lteritalia.it/.

Posidonia oceanica (Foto Claudio Vasapollo)

Siti di emissione vulcanica di CO2 del Castello Aragonese e di altre aree attorno alle coste di Ischia

Si tratta di sistemi di emissione sommersa di CO2 che fuoriesce a temperatura ambiente, e che quindi provoca una naturale acidificazione delle acque circostanti, senza la variazione di altri fattori ambientali. Nelle acque attorno al Castello Aragonese, si forma un vero e proprio gradiente di pH/acidificazione lungo il quale è possibile studiare la variazione e gli adattamenti di specie e comunità associate soprattutto agli habitat rocciosi superficiali ed ai sistemi a Posidonia oceanica. Negli altri siti attorno all’isola d’Ischia, localizzati non lontano dal Castello, vengono interessati da acidificazione naturale anche altri sistemi tipici del Mediterraneo, quali grotte semi-oscure, coralligeno, scogliere e sistemi a Posidonia oceanica più profondi. Nel complesso questi siti permettono di studiare in tempo reale gli effetti dell’acidificazione degli oceani, in rapporto agli scenari futuri di cambiamento climatico, e sono utilizzati dallo staff e dai diversi ospiti/collaboratori, come veri e propri laboratori naturali in cui si effettuare osservazioni ed esperimenti in situ.

Castello S. Anna (Foto Maria Cristina Gambi)

Castello S3 vents macroalghe e Sabella (Photo Enric Ballesteros)

Castello S3 Salpe (Foto Iacono B.)

Progetti di ricerca conclusi 2014-2015

  • ASSEMBLE
  • COST-Action Seagrass Productivity ES0906
  • Tropical signals (CIESM)

Progetti attuali in corso:

  • MIUR Progetto Bandiera RITMARE (2012-2015)
  • VulnerClima (Ritmare-Cofund Bandiera)
  • "Windows on the future ocean" (National Geographic, USA)
  • NEMO (NExt generation Marine Observatories) (Premiali MIUR)
  • Premiali ACIDIT
  • FP7 - Perseus (Policy-oriented marine environmental research in the southern european seas)
  • LTER-Italia
  • LifeWatch MedPan
  • PTSZN(2013-2015)- Programma 4. Variabilità ambientale, cambiamenti climatici e impatti antropici: risposte adattative in specie, comunità e sistemi bentonici

Coordinatore pro tempore

Marco Munari

Primo Ricercatore

Maria Cristina Buia, responsabile laboratorio BENT

Ricercatore

Marco Munari

Tecnologo

Francesco Paolo Patti, responsabile laboratorio TIOM

Collaboratore TER

Bruno Iacono
Maurizio Lorenti
Vincenzo Rando

PhD Students

Butera Emanuela
Antonia Chiarore
Sara Fioretti
Daniele Grech
Mirko Mutalipassi
Rachele Napolitano
Giulia Valvassori

Assegno di Ricerca

Nuria Teixido

Contratto di Ricerca

Rosanna Guglielmo
Lucia Porzio

Segreteria

Messina Rosanna

 

museo

Le collezioni della Stazione Zoologica nascono per soddisfare un’esigenza primaria di ricerca sulle specie marine presenti nel Golfo di Napoli. Grazie però alla forza d’invenzione e all’abilità di Salvatore Lo Bianco, entrato al servizio della Stazione all'età di 14 anni, i metodi di conservazione degli organismi marini furono migliorati a tal punto che la Stazione Zoologica divenne rapidamente celebre per la bellezza e la perfezione tecnica delle sue collezioni di animali marini conservati. Campioni furono perciò venduti a musei, università, scuole e privati entrando di diritto nelle migliori collezioni culturali d’Europa.  Ancor oggi esemplari della Stazione Zoologica, si trovano nei grandi musei naturalistici a Napoli come a Firenze o Berlino.

Progetti con le scuole

Progetti con le scuoleIl museo fa parte del MAB e partecipa perciò ai progetti educativi dell’unità: in particolare nel corso del 2014-2015 è stata allestita in istituto un’aula didattica appositamente attrezzata per visionare al microscopio organismi marini provenienti dalla conservazione. Quest’utile strumento consente di avvicinare anche i più piccoli alla vita del mare e alla ricchezza dei suoi microrganismi. Nelle attività fuori sede ("Collezionare la Natura") si è cercato attraverso l’osservazione dal vivo di conchiglie e animali marini di avvicinare i bambini al disegno scientifico mostrando loro anche i disegni realizzati in Istituto da grandi disegnatori come Merculiano e Serino custoditi in Archivio Storico.

Per il prossimo anno non è stato al momento previsto nessun tipo di attività specifica poichè le collezioni sono temporaneamente stoccate in deposito in attesa che siano avviati i lavori di restauro della futura sede: la Casina del Boschetto sita in Villa Comunale. Tale sede ci consentirà di ampliare enormemente l’offerta formativa arricchendola di visite animate, laboratori e incontri indirizzati non solo agli insegnanti delle scuole di ogni ordine e grado, ma anche e soprattutto a un pubblico extra-scolastico.

Mission del nascente Museo della SZN sarà infatti, avvicinare diverse tipologie di pubblico al ricco patrimonio storico, culturale, scientifico e tecnologico dell’Istituto, formato non solo dalle collezioni di animali marini, ma anche da strumenti utilizzati per la ricerca, dai preziosi testi della biblioteca e dai documenti di archivio storico (fotografie, lettere, disegni...) per ricostruire non solo la vita dell’Istituto ma anche e soprattutto per favorire il processo creativo per cui un individuo è in grado di esplicitare le sue potenzialità all’interno del suo contesto di vita individuale e sociale, locale, territoriale e globale.

Contatti

Claudia di Somma 
Tel. +39 081 5833291
e-mail: claudia.disomma(at)szn.it 

archivio

L'Archivio Storico della Stazione Zoologica Anton Dohrn (ASZN) conserva gli atti che documentano la storia scientifica e culturale dell’Istituto sin dalla sua fondazione (1872). Il primo nucleo fu costituito nel 1969. Include documenti istituzionali, corrispondenza, fotografie, disegni scientifici e altra documentazione che testimonia la storia dell’Istituto. È regolamentato dal Decreto Legislativo n. 42 del 22 gennaio 2004 (Codice dei Beni Culturali e del paesaggio) ed è sottoposto alla vigilanza del Ministero dei beni e delle attività culturali e del turismo – Soprintendenza Archivistica della Calabria e della Campania.
L’Archivio Storico della Stazione Zoologica, ente pubblico di ricerca, ha come suo fine la gestione, tutela e valorizzazione del patrimonio archivistico, e la sua idonea utilizzazione per scopi scientifici, didattici e culturali.

Servizi *

  • Ricerche archivistiche.
  • Consultazione.
  • Fotocopie e Riproduzioni.
  • Prestito (solo per istituzioni).
  • Autorizzazione per Pubblicazioni.

* Alcuni servizi aperti al pubblico possono essere soggetti a particolari restrizioni.

Progetti

archivioL’Archivio fa parte del MAB e partecipa perciò ai progetti educativi dell’unità: in particolare nel corso del 2014-2015 e nell’ambito delle attività rivolte alle scuole ("Caccia al libro", "La Scuola va a bordo"), si è cercato di avvicinare i bambini alla vita della scienza di un tempo attraverso il racconto della nascita e della storia dell’Istituto. Nell’ambito del progetto didattico culturale "La Villa Comunale di Napoli" si sono invece affrontate le tematiche relative all’evoluzione architettonica dell’edificio costruito in 3 tempi diversi (il primo edificio fu terminato nel settembre del 1873. Il secondo, collegato al primo da un ponte fu costruito negli anni 1885-1888, il cortile interno e l’ala est furono aggiunti sono nel 1905).
Nell’ambito delle più generali attività di divulgazione ("Maggio dei monumenti"), si è invece cercato di contestualizzare la storia dell’Istituto all’interno della storia e crescita della città di Napoli, dei rapporti intercorsi con il Comune per la cessione gratuita del suolo fino allo sviluppo di un ente di ricerca unico nel suo genere e conosciuto a livello internazionale.
Ma le attività di valorizzazione del patrimonio ovviamente non si esauriscono con la divulgazione. A più alto livello e in collaborazione con l’ABB Reportages, quest’anno, "Anno internazionale della luce e delle tecnologie basate sulla luce", si è analizzata la figura di Etienne-Jules Marey, medico, ingegnere, artista e autore proprio a Napoli, delle prime immagini filmiche della storia realizzando un film-documentario "Etienne-Jules Marey (1830-1904): scienza nel mattino dell’arte", che ha già ricevuto numerosi consensi ed è stato selezionato per il Festival Internazionale del Fil sull’Arte che si terrà a Montreal (FIFA 2015).
Marey fu intimo amico di Dohrn, con cui condivise per oltre 20 anni sogni, speranze e idee che lo portarono ad analizzare e scomporre il movimento, stimolando nuovi punti di vista nel mondo scientifico artistico e culturale. Per il prossimo anno i progetti saranno subordinati alle priorità definite dall’Ente che al momento sono focalizzate sulla gestione e sulla manutenzione dell’archivio corrente.

Contatti

Claudia di Somma 
Tel. +39 081 5833291
e-mail: claudia.disomma(at)szn.it 

biblioteca

La Biblioteca della Stazione Zoologica nasce nel 1873. Il suo patrimonio è custodito in un edificio di 5 piani ricavato all’interno di un cortile del vecchio edificio al centro della Villa Comunale in Napoli.
La prima collezione libraria fu donata dallo stesso Dohrn per "assistere al meglio tutti coloro che vengono a Napoli a lavorare con la Zoologia Marina o la Botanica" (lettera a Charles Darwin, 1872).
Oggi la biblioteca raccoglie oltre 100,000 volumi (circa 4 chilometri di scaffali), una collezione di oltre 5000 miscellanee contenti estratti, più di 2000 titoli elettronici e database scientifici.

Dal 1875 al 1955 la Biblioteca è stata ospitata nella Sala Affreschi, una sala voluta dallo stesso Dohrn,  dedicata alla musica e al relax che si trova al primo piano dell’edificio principale, così chiamata per il ciclo di affreschi del 1873 del pittore tedesco Hans von Marées e del suo amico scultore e architetto Adolf von Hildebrand. La collezione storica pregiata della Biblioteca è ancor oggi collocata in Sala Affreschi.
La mission della Biblioteca è quella di tutela del patrimonio librario custodito e di essere di supporto alla ricerca dell’Istituto attraverso l’accesso alle risorse informative, le collezioni librarie e i servizi.

Servizi all'utente *

  • Ricerche bibliografiche.
  • Consultazione.
  • Fotocopie e Riproduzioni.
  • Prestito (riservato agli utenti interni).
  • Autorizzazione per pubblicazione.

* Alcuni servizi aperti al pubblico possono essere soggetti a particolari restrizioni.

Progetti

La Biblioteca gioca un ruolo di primo piano  all’interno dei progetti educativi dell’unità e le attività sono sempre personalizzate in base agli eventi e ai partecipanti. In particolare nel corso del 2014-2015 e nell’ambito delle attività rivolte alle scuole ("Caccia al libro", "La Scuola va a bordo"), si è cercato di avvicinare i bambini alla lettura con attività ludico-ricreative attraverso una caccia al tesoro i cui indizi erano nascosti all’interno dei libri seguendo un percorso didattico differenziato per classi e che avesse come tema conduttore il mare e i suoi abitanti.

Contatti

Claudia di Somma 
Tel. +39 081 5833291
e-mail: claudia.disomma(at)szn.it 

Organizzazione dell’attività progettuale istituzionale (Progetti bandiera) tra le diverse strutture di ricerca della Stazione Zoologica.

progetti bandiera

Direttore

Claudia Gili

Dirigente Tecnologo

 

Primo Ricercatore

Paolo G. Albano
Sandra Hochscheid

Ricercatore

Francesco Caruso

Primo Tecnologo

Paola Cirino

Tecnologo

Andrea Affuso
Thalassia Giaccone
Fulvio Maffucci
Passariello Alessandra
Marco Signore
Alfonso Toscano
Maria Cristina Vigo Majello

Collaboratore Tecnico

Davide Caramiello
Elisa Cenci
Maria Pia Ciampa, Supporto Amministrativo
Antonino Costantino
Marcello Cotugno
Giovanni De Martino
Francesco Di Liello
Alberto Macina
Raffaele Panzuto
Domenico Sacco
Ester Scordamaglia
Andrea Travaglini
Gianluca Treglia
Simona Trillo

Collaboratore Amministrativo

Pasqualina Fiorentino

Operatore Amministrativo

Carmela Scotti

Assegni di Ricerca

Antonino Pace

Borse di Ricerca

Marianna Farina
Erica Raquel Ferreira E Moura
Chiara Roncari
Roberta Teti

PhD Students

Raffaella Bullo
Lorenzo Latini
Raffaele Panzuto

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Aggiornato al 16 dicembre 2022

  • AmphioxusNOS - Marie Curie Career Integration Grant (FP7-PEOPLE-2011-CIG)
  • Assemble+ - Consortium of marine biological research stations
  • Corbel - Coordinated Research Infrastructures Building Enduring Life-science Services
  • DiaEdit - Development of genetic tools for the establishment of routine genome editing in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum
  • EMBRIC - European Marine Biological Research Infrastructure Cluster to promote the Blue Bioeconomy
  • ESSEM COST Action ES0906 - Seagrass productivity: from genes to ecosystem management
  • EvoCell - Animal evolution from a cell type perspective: multidisciplinary training in single-cell genomics, evo-devo and in science outreach
  • FishMPABlue2 PLUS - Transferring FishMPABlue2 approach to sustainably manage Small Scale Fisheries in Mediterranean MPAs
  • GRASSMET - Climate change effects on seagrass secondary metabolism: ecological implications
  • HighGrass - High-CO2 effects on seagrass photosynthetic ecophysiology
  • INBALANCE - INvertebrate-BActeriaL Associations as hotspots of benthic Nitrogen Cycling in Estuarine ecosystems
  • LIFE DREAM - Deep REef restoration And litter removal in the Mediterranean sea
  • LIFE European Sharks - European Sharks – a project co-funded by the European Union to safeguard Mediterranean sharks and rays (www.europeansharks.eu)
  • MPA Engage - Engaging Mediterranean key actors in Ecosystem Approach to manage Marine Protected Areas to face Climate Change
  • NEPTUNE - Multidisciplinarity training in evo-devo and neurobiology of marine animal models
  • Ocean Medicines
  • PANTRAC - Gut patterning and PANcreas development in evolution and disease: a TRAnsCriptomic approach
  • PALEOPARK – Seagrass palaeo-records as a tool for the evaluation, diagnosis and prognosis of the evolution of species, communities, and processes in Spanish insular National Parks
  • Progetto S&T MED
  • PharmaDeep
  • PharmaSea
  • RESIGRASS - An holistic understanding of seagrass functioning and resilience to local-scale disturbances: from molecular to biogeographical scales

FishMPABlue2 PLUS - Transferring FishMPABlue2 approach to sustainably manage Small Scale Fisheries in Mediterranean MPAs

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