Direttore

Fiorito Graziano

Dirigente di Ricerca

Maria I. Arnone
Teresa Romeo

Primo Ricercatore

D'Aniello Salvatore
Ristoratore Filomena
Sordino Paolo
Spagnuolo Antonietta

Ricercatore

Amodio Piero
Annunziata Rossella
Arrigoni Roberto
Buono Lorena
D'Aniello Enrico
Ferraro Francesco
Gallo Alessandra
Leone Serena
Liberti Assunta
Locascio Annamaria
Locatello Lisa
Mirra Serena
Modica Maria Vittoria
Ponte Giovanna
Sirakov Maria
Stefanni Sergio
Terzibasi Tozzini Eva

Tecnologo

Benvenuto Giovanna
Chun Jong Tai
Marino Rita

Collaboratore Tecnico

Ferrandino Gabriele, Supporto Amministrativo
Amoroso Alessandro
Francone Maria
Imperadore Pamela
Sommella Andrea

Assegno di Ricerca

Chiavacci Elena
Jimenez-Guri Eva
Liberti Assunta
Paganos Periklis

Rescan Carmelet David

Borse di Ricerca

Cocurullo Maria
Eliso Maria Concetta
Pollastro Carla
Rosapane Marco
Sepe Rosa Maria
Spasiano Erica

PhD Students

Alessandro Tanya
Astoricchio Emanuele
De Vivo Giacinto
Esposito Maria Consiglia
Ferrari Emma
La Vecchia Claudia
Mazzeo Angela
Nocella Elisa
Olivo Paola
Pizzulli Federica
Ritschard Elena
Salatiello Federica
Styfhals Ruth
Tibone Maddalena
Verni Sara
Zuccarotto Annalisa

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Aggiornato al 19 ottobre 2022

Responsabile: Christophe Brunet

Attività

Il laboratorio di Biogeochimica e Fisiologia del Plancton è un laboratorio multidisciplinare che utilizza e sviluppa approcci diversi dedicati allo studio della biogeochimica e fisiologia del fitoplancton marino. Il laboratorio copre attività di ricerca legate all’oceanografia biologica, la biogeochimica e l'ecofisiologia del fitoplancton marino. Principalmente, il laboratorio BioFilP implementa attività e tecniche per lo studio delle risposte delle microalghe alle forzante marine, nell’ambito della comprensione del funzionamento dell’ecosistema pelagico e del potenziale uso delle microalghe nella "Blue Growth".

Sistemi per la sperimentazione

• Camera e sistema di coltivazione di microalghe, con sviluppo di sistemi di illuminazione adeguati per le microalghe.
• Mesocosmi pelagici in situ.

Analisi

• Tasso fotosintetico e regolazione della fotosintesi nelle microalghe.
• Pigmenti negli organismi fotosintetici.
• Bio-ottica delle masse d’acqua e delle colture microalgale.
• Attività antiossidanti nelle microalghe.
• Concentrazioni dei macronutrienti nelle masse d’acqua e nelle colture microalgale.
• Spettro luminoso nelle masse d’acqua.

Strumentazioni

• HPLC per analisi pigmenti.
• PAMs: Dual-pam e PSI.
• Autoanalyzer.
• Spettrofotometro.
• Spettroradiometro immergibile.
• Sonda bio-ottica (AC9) immergibile.
• Cappa a flusso laminare.
• Camera e sistema di coltivazione di microalghe.

Responsabile: Giovanna Romano

Attività

Il Laboratorio di Ecologia Chimica offre strumentazione e supporto per condurre studi di Ecologia Chimica principalmente applicata al plancton marino. Le attività di ricerca svolte nel laboratorio si focalizzano in particolare sullo studio degli effetti dei metaboliti  secondari prodotti dalle diatomee su organismi planctonici e su organismi marini "modello" quali il riccio di mare. Il laboratorio è attrezzato anche per l’estrazione e il primo frazionamento di composti bioattivi e per lo studio della loro attività biologica.

Sistema per la sperimentazione

• Ruota per esperimenti con copepodi.
• Camera termostatata a luce controllata per la crescita di microalghe e sperimentazione con copepodi.
• Dotazione di base per la crescita di microalghe.

Analisi

• Isolamento e identificazione di specie di fito e zooplancton da campioni naturali.
• Determinazione dei tassi di ingestione di organismi marini.
• Saggi di attività biologica per testare l’attività delle diatomee e dei loro metaboliti su copepodi e ricci di mare.
• Analisi al microscopio ottico dei risultati dei saggi biologici.
• Coltivazione di microalghe in vari mezzi di coltura.
• Preparazione di pellet algali tramite centrifugazione.
• Estrazione e primo frazionamento di metaboliti secondari da pellet di microalghe.
• Saggi biochimici e colorimetrici per lo studio del metabolismo delle ossilipine nelle diatomee.

Strumentazione

• Cappa chimica aspirante a espulsione total.
• Stereo-microscopi.
• Microscopi dritti e invertiti.
• Microscopio a fluorescenza corredato di PC e videocamera.
• Centrifughe da banco refrigerate.
• Rotavapor.
• Spettrofotometro.
• Sonicatore a immersione.
• Ph metro.
• Ossigrafo.
• Bagnetto termostatato.

Responsabile: Gabriele Procaccini

Attività

Nel laboratorio di Ecologia Molecolare e Genomica Funzionale si portano avanti studi finalizzati a rispondere a domande ecologiche, con l’utilizzo di approcci di tipo molecolare. Il laboratorio copre attività di ricerca che vanno dalla filogenesi e tassonomia molecolare alla filogeografia e genetica di popolazione, tramite analisi di sequenza ed analisi di marcatori polimorfici, come microsatelliti e SNPs. Ci si occupa anche dello studio della funzione genica mediante approcci di genomica funzionale e genetica inversa (prevalentemente produzione di linee transgeniche di diatomea). Ci si avvale inoltre di analisi di trascrittomica e genomica ambientale e comparativa, e si realizzano studi di espressione genica in condizioni naturali e controllate (RNA-Seq, RT-qPCR ).

Sistema per la sperimentazione

• Mesocosmi per mantenimento di organismi bentonici in condizioni controllate.
• Camera walk-in per colture microalgali.

Analisi

• Estrazione DNA, purificazione e quantificazione.
• Estrazione RNA, purificazione, quantificazione e retrotrascrizione.
• Estrazione di proteine e quantificazione.
• Preparazione campioni per analisi di RT-qPCR in piastra.
• Preparazione campioni per sequenziamento massivo.
• Preparazione campioni per analisi di sequenza.
• Preparazione campioni per analisi di frammenti.
• PCR singole ed in multiplex.
• Elettroforesi su gel di agarosio e di acrilammide.
• Analisi statistiche di genetica di popolazione e filogenesi molecolare.
• Disegno primers, analisi profili elettroferogrammi.
• Clonaggi e trasformazione batterica.
• Preparazione di DNA plasmidico (mini e maxi prep).
• Trasformazione biolistica e produzione di colture transgeniche.
• Colture algali.
• Colorazioni con coloranti vitali fluorescenti ed analisi microscopica.
• Southern blot, Northern blot.
• Western blot e saggi enzimatici (colorimetrici, ELISA).
• Utilizzo di software specialistici per l’analisi banche dati nucleotidiche e proteiche e per l’esplorazione di genomi.

Strumentazione

• Strumentazione di base per la biologia molecolare (PCR, centrifughe, apparati elettroforetici, transilluminatore, bagni termostatici, spettrofotometro, fluorimetro, pH-metro, bilancia di precisione).
• Gene gun (apparecchio per la trasformazione biolistica).
• Cappe per colture algali.
• Microscopi.
• Mixer Mill (Tissue lyser).
• PC e software per analisi molecolari.
• Cappa chimica.
• TurboGen (strumento per la generazione di turbolenza marina).