| Descrizione |
Sequenziamento Sanger di campioni di DNA Il sequenziamento automatizzato del DNA mediante l’elettroforesi capillare rimane uno dei principali ed indispensabili strumenti per lo studio degli acidi nucleici. Le sequenze prodotte sono lunghe in media ~ 650 basi con oltre il 97,5% di precisione, a partire da plasmidi, frammenti di PCR, fagi, etc. La potenzialità del sistema in dotazione al servizio è superiore a 1000 sequenze giornaliere e può sostenere progetti ad alta produttività. Il servizio al momento produce oltre 15.000 sequenze all'anno. |
| Servizi erogati |
1) Sequenze di inserti di DNA clonati in plasmidi (< 15 kb) per ottenere solo le prime informazioni su cloni e subcloni, cioè identità ed orientamento dell’inserto. 2) Sequenze dirette di prodotti di PCR. 3) Sequenziamento fine (double strand) a richiesta e da programmare secondo disponibilità. 4) Shotgun a richiesta e da programmare secondo disponibilità. 5) Gene walking a richiesta e da programmare secondo disponibilità. 6) Transposon-based a richiesta e da programmare secondo disponibilità. 7) Bac ends, lambda-phage, etc. |
| Attrezzature utilizzate |
Analizzatore automatico di DNA per Elettroforesi Capillare Applied Biosystems 3730 DNA Analyzer 48 capillaries - Life Technologies |
| Contatti |
Dr. Elio Biffali Biologia Molecolare e Bioinformatica Tel. +39 081 5833298 e-mail: elio.biffali(at)szn.it |
| Descrizione |
In allestimento Il servizio di digital PCR è dotato di uno strumento ad alta sensibilità Bio-Rad “QX200 Droplet Digital PCR” che consente di: - Rilevare piccole quantità di molecole DNA bersaglio con una sensibilità senza pari. - Determinare la variazione del numero di copie genomiche (copy number variation) con estrema accuratezza. - Misurare livelli di espressione genica con straordinaria precisione. - Quantificare librerie NGS. |
| Servizi erogati | Il servizio supporta gli utenti nel design degli esperimenti, nell’utilizzo dell’apparecchiatura e, se necessario, nella prima analisi dei dati. |
| Attrezzature utilizzate | |
| Contatti |
Dr. Elio Biffali Biologia Molecolare e Bioinformatica Tel. +39 081 5833298 e-mail: elio.biffali(at)szn.it |
| Descrizione | Analisi qualitativa e quantitativa di acidi nucleici mediante Bioanalyzer 2100 Agilent che utilizza un chip microfluidico, rappresentando lo standard di riferimento per il QC di campioni di RNA da utilizzare in applicazioni sensibili quali la qPCR, i microarray, l’ibridazione in situ, il next generation sequencing, la generazione di librerie, etc. |
| Servizi erogati |
Lettura di cDNA, RNA totale, mRNA, RNA inferiori a 200 nucleotidi (microRNA, siRNA, scRNA, snoRNA, piRNA, 5S RNA, 5.8S rRNA). Caratterizzazione qualitativa e quantitativa mediante l'utilizzo di: - NANO chip (disponibile presso il servizio) - PICO chip (fornito dall'utenza) - “small RNA chip” (fornito dall'utenza) |
| Attrezzature utilizzate | Agilent Bioanalyzer 2100 |
| Contatti |
Dr. Elio Biffali Biologia Molecolare e Bioinformatica Tel. +39 081 5833298 e-mail: elio.biffali(at)szn.it |
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Descrizione |
Il servizio di Real Time qPCR è dotato di uno strumento ad alta produttività che, utilizzando piastre a 384 pozzetti, non solo permette di analizzare un numero elevato di campioni nello stesso esperimento, ma anche, riducendo i volumi di reazione, di ottenere un costo ridotto per la singola reazione. |
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Servizi erogati |
Il servizio supporta gli utenti nel design degli esperimenti, nell’utilizzo della apparecchiatura e, se necessario, nella prima analisi dei dati. |
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Attrezzature utilizzate |
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Contatti |
Dr. Elio Biffali Biologia Molecolare e Bioinformatica Tel. +39 081 5833298 e-mail: elio.biffali(at)szn.it |
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