Responsabile: Adrianna Ianora

Attività

Il laboratorio di Biotecnologie è un laboratorio multidisciplinare che utilizza e sviluppa approcci diversi, dedicati allo studio delle biotecnologie marine. Il laboratorio copre attività di ricerca legate al campionamento, isolamento e mantenimento di specie marine di interesse biotecnologico (soprattutto microalghe), preparazione di estratti chimici, test delle possibili bioattività degli estratti sia su organismi marini che su cellule umane, analisi a livello genico e proteico sia sulle specie marine risultate attive che su cellule umane.

Sistemi per la sperimentazione

• Facilities per analisi molecolari e chimiche applicate alle biotecnologie marine.
• Camera per colture cellulari umane (cappa biologica tipo 1, incubatore per cellule umane, microscopio).
• Camera per crescita algale.
• Camera con 2 Bioreattori.

Analisi

• Isolamento e mantenimento di microalghe a potenziali applicazioni biotecnologiche.
• Coltivazione su piccola (flask), media (10L carboys) e grande scala (fotobioreattori  da 100 L) di microalghe.
• Genotipizzazione di nuove specie mediante sequenziamento di DNA.
• Saggi di attività biologica di estratti, frazioni chimiche e composti puri su specie marine modello e su linee cellulari umane.
• Saggi di attività antiproliferativa e clonogenicità nei confronti di linee tumorali aggressive.
• Saggi di attività antiossidante e anti-infiammatoria su linee cellulari normali.
• Saggi di attività da danni indotti dalla senescenza cellulare (anti-aging).
• Saggi di attività specifica nei confronti di alcune patologie umane croniche (diabete, Alzheimer, morbo di Crohn).
• Studi molecolari a livello genico e proteico per monitorare l’attività specifica esercitata dalle sostanze bioattive su cellule umane (trasfezione retrovirale, PCR array, immunoblot, ELISA).
• Analisi trascrittomica delle specie microalgali.

Strumentazione

• Strumentazione di base per la biologia molecolare e analisi proteica (PCR, centrifughe, apparati elettroforetici, transilluminatore, bagni termostatici, spettrofotometro,  pH-metro, transblot).
• Cappa biologica tipo 2 per colture algali.
• Cappa chimica.
• Microscopi.
• 2 Fotobioreattori (100 L).

• AmphioxusNOS - Marie Curie Career Integration Grant (FP7-PEOPLE-2011-CIG)
• Assemble+ - Consortium of marine biological research stations
• CercleBleu - Accélérateur d’Innovation Transfrontalier pour la Gestion et la Valorisation du Crabe Bleu dans une Approche Circulaire
• Corbel - Coordinated Research Infrastructures Building Enduring Life-science Services
• DecarbonyT - Decarbonisation of the fishing fleet in the Mediterranean and Black Sea
• DiaEdit - Development of genetic tools for the establishment of routine genome editing in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum
• EMBRIC - European Marine Biological Research Infrastructure Cluster to promote the Blue Bioeconomy
• ESSEM COST Action ES0906 - Seagrass productivity: from genes to ecosystem management
• EvoCell - Animal evolution from a cell type perspective: multidisciplinary training in single-cell genomics, evo-devo and in science outreach
• FishMPABlue2 PLUS - Transferring FishMPABlue2 approach to sustainably manage Small Scale Fisheries in Mediterranean MPAs
• GRASSMET - Climate change effects on seagrass secondary metabolism: ecological implications
• GreenList4MMPAs - project funded by the Interreg Euro-MED programme, which aims to promote effective and equitable management of Marine Protected Areas (MPAs) in the Mediterranean Region 
• HighGrass - High-CO₂ effects on seagrass photosynthetic ecophysiology
• INBALANCE - INvertebrate-BActeriaL Associations as hotspots of benthic Nitrogen Cycling in Estuarine ecosystems
• LIFE TURTLENEST - Caretta caretta nesting range expansion under climate warming: urgent actions to mitigate threats at emerging nesting sites in the Western Mediterranean
• LIFE DREAM - Deep REef restoration And litter removal in the Mediterranean sea
• LIFE European Sharks - European Sharks – a project co-funded by the European Union to safeguard Mediterranean sharks and rays (www.europeansharks.eu)
• LIFE OASIS - Mitigating the negative interactions of protected species with marine litter and pelagic fisheries of the Mediterranean
• MIRAMAR - Monitoring cumulative Impact to guide mitigation and RestorAtion in the MediterrAnean Region (MIRAMAR)
• MPA Engage - Engaging Mediterranean key actors in Ecosystem Approach to manage Marine Protected Areas to face Climate Change
• NEPTUNE - Multidisciplinarity training in evo-devo and neurobiology of marine animal models
• Ocean Medicines
• PANTRAC - Gut patterning and PANcreas development in evolution and disease: a TRAnsCriptomic approach
• PALEOPARK – Seagrass palaeo-records as a tool for the evaluation, diagnosis and prognosis of the evolution of species, communities, and processes in Spanish insular National Parks
• Progetto S&T MED
• PharmaDeep
• PharmaSea
• RESIGRASS - An holistic understanding of seagrass functioning and resilience to local-scale disturbances: from molecular to biogeographical scales
• SPILLOVER-MED - Assessing spillover from marine protected areas to adjacent fisheries: Mediterranean and Black Seas
• TecMAReco - Tecnologie ad alta risoluzione per il monitoraggio di rifiuti marini e rilevamento di effetti sugli ecosistemi marini protetti, verso un sistema di rilevamento rapido transfrontaliero

Referente: Marina Montresor

Attività

Il laboratorio contiene  attrezzature e infrastrutture utilizzate per lo studio della diversità tassonomica e funzionale del plancton marino. In particolare, in questo laboratorio vengono condotte analisi sulla diversità tassonomica e molecolare di campioni di plancton raccolti principalmente nel sito Long Term Ecological Research MareChiara nel Golfo di Napoli, ma anche in seguito a partecipazione a progetti a scala regionale e globale. La sperimentazione riguarda la fisiologia e i cicli vitali delle microalghe marine e il comportamento alimentare dello zooplancton.

Sistemi per la sperimentazione

• Camera walk-in a temperatura e luce controllate ed incubatori di diverso volume per sperimentazione in vivo con fito- e zooplancton.
• Sistema ottico per riprese video di organismi zooplanctonici.
• Supporto rotante (plankton wheel) per sperimentazione con fito-, micro- e mesozooplancton.

Analisi

• Analisi quali-quantitative di fito- e zooplancton marino.
• Allestimento di colture di fitoplancton e loro caretterizzazione mofologica e molecolare.
• Analisi di filogenesi molecolare.
• Analisi di "metabarcode" del plancton marino con approcci NGS.

Strumentazione

• Stereoscopi e microscopi ottici.
• Microscopi con sistema di illuminazione ad epifluorescenza e telecamere digitali per la ripresa fotografica e filmati.
• Zooscan con relativo software.
• Sistema di telecamere per riprese video di zooplancton.
• Area attrezzata per l’isolamento di colture e la sperimentazione (cappa a flusso laminare, microscopi per isolamento, fluorimetro).
• Laboratorio molecolare attrezzato per estrazione di DNA, PCR, DNA elettroforesi, preparazione per NGS sequencing.

• ABBaCo - Restauro Ambientale e Balneabilità del SIN Bagnoli-Coroglio
• CON24MMANG ISPRA D6 03 - Comunità epimegabentoniche - Studio delle comunità epimegabentoniche sottoposte a perturbazioni fisiche
• CIR01_00029 - Potenziamento Ricerca e Infrastrutture Marine (EMBRC –IT) - Rafforzamento del capitale umano
• CRIMAC - Centro Ricerche ed Infrastrutture Marine Avanzate in Calabria (CRIMAC) - Fondo FSC 2014-2020 - Piano Stralcio «Ricerca e Innovazione 2015-2017» – Programma Nazionale Infrastrutture di Ricerca (PNIR), linea d’azione 1. Cofinanziamento Infrastrutture di Ricerca (IR)»
• EMBRC-UP, “EMBRC Unlocking the Potential for Health and Food from the seas” - Rafforzamento e creazione di Infrastrutture di Ricerca” da finanziare nell’ambito del PNRR, Missione 4, “Istruzione e Ricerca” - Componente 2, “Dalla ricerca all’impresa” - Linea di investimento 3.1, “Fondo per la realizzazione di un sistema integrato di infrastrutture di ricerca e innovazione”, finanziato dall’Unione europea – NextGenerationEU
• Empowering an integrated platform for the study of human diseases with great impact by means of system phenotyping of model animals: mouse and zebrafish clinic (MouZeCLINIC)
• NBFC - National Biodiversity Future Center - Proposte di intervento per il Potenziamento di strutture di ricerca e creazione di “campioni nazionali” di R&S su alcune Key Enabling Technologies da finanziare nell’ambito del Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza”, Missione 4 Componente 2 Investimento 1.4 “Potenziamento strutture di ricerca e creazione di "campioni nazionali di R&S" su alcune Key Enabling Technologies” finanziato dall’Unione europea – NextGenerationEU.
• EMSO MedIT - PON R&C 2007-2013 - PAC Potenziamento infrastrutture di ricerca pubblica - Linea di intervento B. Interventi per l’adeguamento e il consolidamento di infrastrutture per il monitoraggio ambientale
• IRMA: Implementazione e connessione Remota di una piattaforma per il monitoraggio in tempo reale di microorganismi Marini
• FIRB, MIUR-Cineca - Non-Coding RNA Explosion: Novel Implications in Neurotrophin Biology
• 13/RBC/20 MoSic - Monitoraggio Sic in Calabria
• PIR01_00018 - IPANEMA Implementazione del laboratorio naturale ECCSEL di Panarea e dell’osservatorio marino
  PIR01_00029 - PON-PRIMA Potenziamento Ricerca e Infrastrutture Marine (EMBRC–IT)
• PIR01_00030 - PON-InSEA - Iniziative in Supporto al consolidamento e potenziamento dell’infrastruttura EMSO e delle sue attività
• PON01_02093 Studio di nuove tecnologie e piattaforme tecnologiche per il miglioramento di processi produttivi di principi attivi farmaceutici di interesse industriale e ricerca di nuove molecole bioattive da sorgenti naturali - Capofila: Sanofi-Aventis S.p.A.
• PON01_02782 Nuove strategie nanotecnologiche per la messa a punto di farmaci e presidi diagnostici diretti verso cellule cancerose circolanti (CTC) - Capofila: Biogem S.c.a r.l.
• PON01_00117 Antigeni e Adiuvanti per Vaccini e Immunoterapia - Capofila: Novartis Vaccines & Diagnostics srl
• Progetto Nazionale di Ricerca in Antartide (PNRA) - Funzionamento degli ecosistemi costieri in un Oceano Antartico in cambiamento (CEFA)
• PRIMAR - Potential Role of Sea Ice change in controlling Mercury in coastal Antarctic Areas
• PROSHARKS - Living on the extinction edge: bridging knowledge gaps to PROtect threatened coastal SHARKS in the central Mediterranean Sea, finanziato dal Ministero dell'Università e della Ricerca (MUR) nell'ambito del programma PRIN 2022, è dedicato alla conservazione degli squali demersali nel Mediterraneo
• Reconnect - Reconciling conservation and exploitation of a keystone species through networks of Marine Protected Areas - 2022Y3TMR7 - Finanziato dal programma PRIN del MUR 
• Recovering Southern Apulia Seascape for a thriving ocean and resilient communities
• SPILLOVER-MED - Assessing spillover from marine protected areas to adjacent fisheries: Mediterranean and Black Seas
• SPREAD - Unraveling environmental and anthropogenic factors ShaPing the snow microbiome and antibiotic REsistome At Dome C (Antarctica)
• SUNRISE - Le soluzioni basate sulla natura per la conservazione della biodiversità marina e lo sviluppo sostenibile in Mar Ligure - progetto finanziato nel quadro del “Bando Simbiosi - Insieme alla natura per il futuro del Pianeta», promosso da Fondazione Compagnia di San Paolo
• TRASForMARE - Technology TRAnSfer Office For MAnagement of Research Exploitation results, finanziato nell’ambito del PNRR, è finalizzato al potenziamento delle attività di trasferimento tecnologico della Stazione Zoologica Anton Dohrn (SZN), con l’obiettivo di rafforzare la valorizzazione dei risultati della ricerca e favorirne il trasferimento verso il sistema produttivo.