Collaboratore Tecnico
Dipartimento Infrastrutture di ricerca per le risorse biologiche marine (RIMAR) – Unità di Bioinformatica
e-mail: luca.ambrosino(at)szn.it
Tel. +39 081 5833452
Interessi di ricerca
Sono un biotecnologo molecolare con un Dottorato di Ricerca in Biologia Computazionale e Bioinformatica acquisito presso l’Università degli Studi di Napoli “Federico II”. Ho esperienze lavorative al CEINGE - Biotecnologie Avanzate S.c.a.r.l. dove mi sono occupato della caratterizzazione strutturale di mutanti di enzimi umani correlati a patologie rilevate con screening neonatali; all’ Istituto di Biochimica delle Proteine (IBP) del CNR dove ho lavorato sulla caratterizzazione strutturale e funzionale enzimi estremofili con potenziale biotecnologico; all’ Istituto di Bioscienze e Biorisorse (IBBR) del CNR lavorando su genomica funzionale e comparativa di specie di interesse agronomico; alla Facoltà di Agraria dell’Università degli Studi di Napoli “Federico II” dove mi sono occupato di genomica comparativa ed evoluzione molecolare di piante di interesse agronomico; alla Stazione Zoologica Anton Dohrn occupandomi di genomica strutturale e funzionale, genomica comparativa ed evoluzione molecolare, trascrittomica e proteomica applicata ad organismi marini.
Mansioni
Faccio parte dell’ unità di “Bioinformatica, Analisi Computazionale & Data Management (BAC) di istituto. All’interno dell’unità, sono il referente per analisi genomiche, trascrittomiche e proteomiche. Lavoro principalmente allo sviluppo di strumenti e servizi bioinformatici per la ricerca in ambito marino in SZN.
Principali Pubblicazioni
Pazzaglia, J., Santillán-Sarmiento, A., Ruocco, M., Dattolo, E., Ambrosino, L., Marín-Guirao, L., & Procaccini, G. (2022). Local environment modulates whole-transcriptome expression in the seagrass Posidonia oceanica under warming and nutrients excess. Environmental Pollution, 119077. DOI: 10.1016/j.envpol.2022.119077
Sabatino, V., Orefice, I., Marotta, P., Ambrosino, L., Chiusano, M. L., d’Ippolito, G., ... & Ferrante, M. I. (2022). Silencing of a Pseudo-nitzschia arenysensis lipoxygenase transcript leads to reduced oxylipin production and impaired growth. New Phytologist. DOI: https://doi.org/10.1111/nph.17739
Del Mondo, A., Smerilli, A., Ambrosino, L., Albini, A., Noonan, D. M., Sansone, C., & Brunet, C. (2021). Insights into phenolic compounds from microalgae: structural variety and complex beneficial activities from health to nutraceutics. Critical Reviews in Biotechnology, 41(2), 155-171. DOI: https://doi.org/10.1080/07388551.2021.1874284
Sañé, E., Del Mondo, A., Ambrosino, L., Smerilli, A., Sansone, C., & Brunet, C. (2021). The Recent Advanced in Microalgal Phytosterols: Bioactive Ingredients Along With Human-Health Driven Potential Applications. Food Reviews International, 1-20. DOI: https://doi.org/10.1080/87559129.2021.1938115
Esposito, A., Ambrosino, L., Piazza, S., D’Aniello, S., Chiusano, M.L., Locascio, A. (2021). Evolutionary Adaptation of the Thyroid Hormone Signaling Toolkit in Chordates. Cells 10(12), 3391. DOI: https://doi.org/10.3390/cells10123391
Marotta, P., Salatiello, F., Ambrosino, L., Berruto, F., Chiusano, M. L., & Locascio, A. (2021). The ascidia Ciona robusta provides novel insights on the evolution of the AP-1 transcriptional complex. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2093. DOI: https://doi.org/10.3389/fcell.2021.709696
Ruocco, M., Ambrosino, L., Jahnke, M., Chiusano, M. L., Barrote, I., Procaccini, G., Silva, J, and Dattolo, E. (2020). m6A RNA Methylation in Marine Plants: First Insights and Relevance for Biological Rhythms. International Journal of Molecular Sciences, 21(20), 7508. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms21207508
Lauritano, C., Roncalli, V., Ambrosino, L., Cieslak, M. C., and Ianora, A. (2020). First De Novo Transcriptome of the Copepod Rhincalanus gigas from Antarctic Waters. Biology, 9(11), 410. DOI: https://doi.org/10.3390/biology9110410
Elagoz, Ali M., Ambrosino, L., and Lauritano, C. (2020) "De novo transcriptome of the diatom Cylindrotheca closterium identifies genes involved in the metabolism of anti-inflammatory compounds." Scientific reports 10.1: 1-9. DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-020-61007-0
Ambrosino, L., Colantuono, C., Diretto, G., Fiore, A., and Chiusano, M. L. (2020). Bioinformatics Resources for Plant Abiotic Stress Responses: State of the Art and Opportunities in the Fast Evolving-Omics Era. Plants, 9(5), 591. DOI: https://doi.org/10.3390/plants9050591
Ambrosino, L.; Tangherlini, M.; Colantuono, C.; Esposito, A.; Sangiovanni, M., Miralto, M., Sansone, C., and Chiusano, M.L. (2019). “Bioinformatics for Marine Products: An Overview of Resources, Bottlenecks, and Perspectives.” Marine drugs 17, (10). DOI: 10.3390/md17100576
Esposito, A.; Tamburini, S.; Triboli, L.; Ambrosino, L.; Chiusano, M. L., and Jousson, O. (2019) “Insights into the genome structure of four acetogenic bacteria with specific reference to the Wood-Ljungdahl pathway.” MicrobiologyOpen 2019, e938. DOI: 10.1002/mbo3.938
Ambrosino, L., Vassalli, Q. A., D'Agostino, Y., Esposito, R., Cetrangolo, V., Caputi, L., Amoroso, A., Aniello, F., D'Aniello, S., Chatzigeorgiou, M., Chiusano, M.L., and Locascio, A. (2019). "Functional conserved non-coding elements among tunicates and chordates." Dev Biol 448(2): 101-110. DOI: 10.1016/j.ydbio.2018.12.012
Ambrosino, L., Ruggieri, V., Bostan H., Miralto, M., Vitulo, N., Zouine, M., Barone, A., Bouzayen, M., Frusciante, L., Pezzotti, M., Valle, G., Chiusano, M.L. (2018) “Multilevel comparative bioinformatics to investigate evolutionary relationships and specificities in gene annotations”, BMC Bioinformatics 19(15): 435. DOI: 10.1186/s12859-018-2420-y
Ambrosino, L., Colantuono, C., Monticolo, F., and Chiusano, M. L. (2018). “Bioinformatics resources for plant genomics: bottlenecks and opportunities in the -omics era.” in “Next-generation Sequencing and Bioinformatics for Plant Science” Current Issues in Molecular Biology 71-88 DOI: 10.21775/cimb.027.071
Ambrosino, L., Chiusano, M.L. (2017). “Transcriptologs: a transcriptome-based approach to predict orthology relationships.” Bioinformatics and Biology Insights 11 DOI: 10.1177/1177932217690136
De Santi, C., B. Altermark, M. M. Pierechod, L. Ambrosino, D. de Pascale and N. P. Willassen (2016). "Characterization of a cold-active and salt tolerant esterase identified by functional screening of Arctic metagenomic libraries." BMC Biochem 17(1): 1 DOI: 10.1186/s12858-016-0057-x
Ambrosino, L., Bostan, H., Ruggieri, V., and Chiusano, M. L. (2016). “Bioinformatics resources for pollen.” Plant reproduction 29 (1-2), 133-147 DOI: 10.1007/s00497-016-0284-8
Ambrosino, L., H. Bostan, P. di Salle, M. Sangiovanni, A. Vigilante and M. L. Chiusano (2016). "pATsi: Paralogs and Singleton Genes from Arabidopsis thaliana." Evol Bioinform Online 12: 1-7 DOI: 10.4137/EBO.S32536
De Santi, C., L. Ambrosino, P. Tedesco, L. Zhai, C. Zhou, Y. Xue, Y. Ma and D. de Pascale (2015). "Identification and characterization of a novel salt-tolerant esterase from a Tibetan glacier metagenomic library." Biotechnol Prog 31(4): 890-899 DOI: 10.1002/btpr.2096
Maiorano, F., L. Ambrosino and M. R. Guarracino (2015). The MetaboX Library: Building Metabolic Networks from KEGG Database. Bioinformatics and Biomedical Engineering: Third International Conference, IWBBIO 2015, Granada, Spain, April 15-17, 2015, Proceedings, Part I. F. Ortuño and I. Rojas. Cham, Springer International Publishing: 565-576 DOI: 10.1007/978-3-319-16483-0_55
De Santi, C., P. Tedesco, L. Ambrosino, B. Altermark, N. P. Willassen and D. de Pascale (2014). "A New Alkaliphilic Cold-Active Esterase from the Psychrophilic Marine Bacterium Rhodococcus sp.: Functional and Structural Studies and Biotechnological Potential." Appl Biochem Biotechnol. DOI: 10.1007/s12010-013-0713-1
