Ricercatore
Dipartimento di Ecologia Marina Integrata
Tel. +39 081 5833280
e-mail: ylenia.carotenuto(at)szn.it
Skype: carotylene
Interessi di ricerca
Ecologia chimica, ecologia molecolare, interazione diatomee-copepodi, riproduzione e sviluppo dei copepodi, Next Generation Sequencing.
I miei interessi di ricerca sono incentrati sulle interazioni fitoplancton-zooplancton negli ecosistemi marini e sul loro impatto sul funzionamento degli ecosistemi. In particolare, la mia attività mira ad analizzare l’impatto della biodiversità delle microalghe, in termini di specie, tratti biologici e produzione di ‘info-chemicals’ (tossine ed ossilipine), sull’ingestione, la riproduzione, lo sviluppo larvale e l’espressione genica dei copepodi, e le ricadute che ne conseguono sulla dinamica di popolazione di questi crostacei. Le ossilipine sono metaboliti secondari prodotti dalle diatomee che inducono anomalie morfologiche e danno cellulare negli stadi larvali e nei copepodi adulti, riducendo il successo di schiusa degli embrioni, i tassi di sviluppo delle larve. La produzione di ossilipine da parte delle diatomee ha serie ripercussioni sulla dinamica di popolazione dei copepodi, ed è quindi fondamentale studiare il ruolo ecologico di tali composti nell’ambiente marino.
La mia attività di ricerca comprende approcci disciplinari e metodologici multipli, che includono la determinazione di parametri ecologici in diverse specie di copepodi (tassi di ingestione, produzione e vitalità delle uova, sopravvivenza larvale), in condizioni controllate di laboratorio ed in situ (Golfo di Napoli e Nord Adriatico), l’analisi dell’espressione genica quantitativa (RT-qPCR) ed il sequenziamento massivo dei trascrittomi. Recentemente, la mia attività si è estesa allo studio dell’impatto dello stress antropico (inquinanti e nanomateriali) sui copepodi.
Principali Pubblicazioni
Carotenuto Y, Di Capua I, Di Pinto M, Palumbo F, Percopo I, Uttieri M, Miralto A, Mazzocchi MG, Ianora A. 2023. Twenty-year trends of Centropages typicus (Copepoda, Calanoida) reproduction, feeding, population abundance and structure in the Gulf of Naples (Western Mediterranean Sea). Marine Ecology, e12739. doi.org/10.1111/maec.12739
Roncalli, V., Uttieri, M., Capua, I. D., Lauritano, C., Carotenuto, Y. (2022). Chemosensory-Related Genes in Marine Copepods. Marine Drugs, 20(11), 681.
Russo E, Lauritano C, d’Ippolito G, Fontana A, Sarno D, von Elert E, ianora A, Carotenuto Y, 2020. RNA-Seq and differential gene expression analysis in Temora stylifera copepod females with contrasting non-feeding nauplii survival rates: an environmental transcriptomics study. BMC Genomics, 21:693. doi:10.1186/s12864-020-07112-w
Russo, E., d’Ippolito, G., Fontana, A., Sarno, D., D’Alelio, D., Busseni, G., Ianora, A., von Elert, E., Carotenuto, Y. 2020. Density-dependent oxylipin production in natural diatom communities: possible implications for plankton dynamics. The ISME Journal, 14:164-177. doi.org/10.1038/s41396-019-0518-5.
Carotenuto Y., Vitiello V., Gallo A., Libralato G., Trifuoggi M., Toscanesi M., Lofrano G., Esposito F., Buttino I., 2020. Assessment of the relative sensitivity of the copepods Acartia tonsa and Acartia clausi exposed to sediment-derived elutriates from the Bagnoli-Coroglio industrial area. Marine Environmental Research, 155: 104878. doi.org/10.1016/j.marenvres.2020.104878
Saha, M., Berdalet, E., Carotenuto, Y., Fink, P. Harder, T., John, U., Not, F., Pohnert, G., Potin, P., Selander, E., Vyverman, W., Wichard, T., Zupo, V., Steinke, M. 2019. Using chemical language to shape future marine health. Frontiers in Ecology and the Environment, 17(9):530-537. doi:10.1002/fee.2113.
Ianora, A., Bastianini, M., Carotenuto, Y., Casotti, R., Roncalli, V., Miralto, A., Romano, G., Gerecht, A., Fontana, A., Turner, J.T. 2015. Non-volatile oxylipins can render some diatom blooms more toxic for copepod reproduction. Harmful Algae, 44: 1-7. doi:10.1016/j.hal.2015.02.003.
Carotenuto, Y., Dattolo, E., Lauritano, C., Pisano, F., Sanges, R., Miralto, A., Procaccini, G., and Ianora, A. 2014. Insights into the transcriptome of the marine copepod Calanus helgolandicus feeding on the oxylipin-producing diatom Skeletonema marinoi. Harmful Algae, 31: 153-162. doi:10.1016/j.hal.2013.11.002.
Carotenuto, Y., Wichard, T., Pohnert, G., Lampert, W. 2005. Life history responses of Daphnia pulicaria to diets containing freshwater diatoms: effects of nutritional quality versus polyunsaturated aldehydes. Limnology and Oceanography, 50 (2): 449-454. doi:10.4319/lo.2005.50.2.0449.
Ianora, A., Miralto, A., Poulet, S. A., Carotenuto, Y., Buttino, I., Romano, G., Casotti, R., Pohnert, G., Wichard, T., Colucci-D'Amato, L., Terrazzano, G. and Smetacek, V. 2004. Aldehyde suppression of copepod recruitment in blooms of a ubiquitous planktonic diatom. Nature, 429 (6990): 403-407. doi:10.1038/nature02526.
Websites
Google scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=it&user=JJqevnAAAAAJ
Databases and repositories
Assembled transcripts of the copepod Calanus helgolandicus deposited in the Transcriptome Shotgun Assembly (TSA) DDBJ/ENA/GenBank, under the accession GJFL00000000. The version is the first version, GJFL01000000. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2052687266
Assembled transcripts of the copepod Temora stylifera deposited in the Transcriptome Shotgun Assembly (TSA) DDBJ/ENA/GenBank, under the accession GJGX00000000. The version is the first version, GJGX01000000; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2073957858
Nucleotide sequences: 140 million of Raw Reads of the copepod Temora stylifera deposited in NCBI Sequence Read Archive (SRA), repository accession number PRJNA632714; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/PRJNA632714
Nucleotide sequences: 600 million of Raw Reads of the copepod Calanus helgolandicus deposited in NCBI Sequence Read Archive (SRA), repository accession number PRJNA640515; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/ PRJNA640515
EST (440) of Calanus helgolandicus deposited in GenBank dbEST Database on 09/01/2014 (GenBank Library Accession Number: LIBEST_028336. GenBank EST Accession numbers: JZ532668-JZ533437).
Nucleotice sequences: 10 sequences of Calanus helgolandicus deposited in GenBank Nucleotide Database on 22/12/2013 (GenBank Accession numbers: KC521529-KC521538).
Foto
Immagini al microscopio ottico di embrioni di copepode Calanus helgolandicus allo stadio di 16 blastomeri. Uova deposte dopo alimentazione delle femmine con dieta di controllo (A, embrione normale) o con diatomee che inducono la formazione di embrioni abnormali (B, embrione con ridotte divisioni cellulari).
Immagine al microscopio confocale a scansione laser di stadio larvale NVI del copepode Temora stylifera, marcato con colorante fluorescente (vista ventrale).
