Primo Tecnologo - II livello
Dipartimento Infrastrutture di ricerca per le risorse biologiche marine
Tel. +39 081 5833284
Fax: +39 081 5833292
e-mail: marco.borra(at)szn.it
Skype: marborra
Attività
Dal 03/09/2018 al 03/09/2021 - Direttore del Dipartimento Infrastrutture di ricerca per le risorse biologiche marine
Dal 18/05/2016 Responsabile della Cooperazione Internazionale e pianificazione strategica
Attività precedenti
Tecnologo in un Core Facility, di supporto a gli altri laboratori con tecniche di biologia molecolare, fornendo una serie di servizi e centralizzando alcuni complessi processi tecnologici come:
• Sequenziamento
• Analisi Frammenti
• SNiPs
• Real Time PCR
Automazione robotica di: (i) procedure di interesse generale (ad esempio gDNA estrazione; DNA mini-preparations, preparazione della PCR e di purificazione; allestimento reazione qPCR; ecc.), (ii) le procedure di routine utilizzate nei Servizi; (iii) progetti di throughput medio "on demand".
Inoltre, la Core Facility offre consulenza tecnico-scientifica, formazione, indagini tecniche e di mercato, prove comparative di nuovi prodotti e protocolli e ha anche un ruolo attivo per quanto riguarda gli studi di fattibilità e / o realizzazione di test tecnologici innovativi applicati a specifiche esigenze dei laboratori di ricerca. Notevole attenzione è anche data all’attività di formazione, a diversi livelli, nelle tecniche di biologia molecolare e allo sviluppo e l'ottimizzazione dei protocolli.
Coinvolto nello sviluppo, gestione e realizzazione di tutte le attività del Servizio, con particolari responsabilità per l'automazione e Real Time PCR. Sono responsabile dello sviluppo e della gestione di tutte le nuove procedure di automazione e dell’introduzione di nuove tecnologie come Real Time PCR e NGS. Supporto per altri laboratori nella progettazione delle analisi di qPCR, nella realizzazione e nella validazione dei dati.
Liaison Officer per il progetto UE EMBRC-IT, author of 23 peer reviewed papers.
Principali Pubblicazioni
Luigi Caputi, Marco Borra, Elio Biffali Nikos Andreakis and Paolo Sordino. SNPs and Hox gene mapping in Ciona intestinalis. BMC Genomics 2008, 9:39.
M Sirakov, I Zarrella, M Borra, F Rizzo, E Biffali, M I Arnone, G Fiorito Selection and validation of a set of reliable reference genes for quantitative RT-PC studies in the Cephalopod Mollusc (Ocropus vulgaris). BMC Molecular Biology 2009, 10:70
Tristano Bacchetti De Gregoris, Marco Borra, Elio Biffali, Thomas Bekel, J Grant Burgess, Richard R Kirby, Anthony S Clare. Construction of an adult barnacle (Balanus amphitrite) cDNA library and selection of reference genes for quantitative RT-PCR studies. BMC Molecular Biology 2009, 10:62.
Chiara Lauritano, Marco Borra, Ylenia Carotenuto, Elio Biffali, Antonio Miralto, Gabriele Procaccini, Adrianna Ianora. Molecular Evidence of the Toxic Effects of Diatom Diets on Gene Expression Patterns in Copepods. PLoS ONE 6(10): e26850. doi:10.1371/journal.pone.0026850. 2011
Maria Sirakov*, Marco Borra*, Michelina Plateroti. Defining suitable reference genes for RT-qPCR analysis on intestinal epithelial cells. Molecular Biotechnology. DOI 10.1007/s12033-012-9643-3 06/01/2013 - *equal contribution
Vuttariello E, Borra M, Calise C, Mauriello E, Greggi S, Vecchione A, Biffali E, Chiappetta G. A new rapid methodological strategy to assess BRCA mutational status. Molecular Biotechnology, MOBI DOI 10.1007/s12033-012-9646-0. 26/01/2013
Maria Grazia Adelfi, Marco Borra, Remo Sanges, Marina Montresor, Angelo Fontana and Maria Immacolata Ferrante. Selection and validation of reference genes for qPCR analysis in the pennate diatoms Pseudo-nitzschia multistriata and Pseudo-nitzschia arenysensis. JEMBE Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 451C (2014), pp. 74-81 DOI information: 10.1016/j.jembe.2013.11.003.
Bruna De Felice, Paolo Mondola, Giuseppe Orefice, Vincenzo Bresciamorra, Giovanni Vacca, Elio Biffali, Marco Borra, Raimondo Pannone and Anna Sasso. Small non-coding RNA signature in Multiple Sclerosis patients after treatment with Interferon-beta. BMC Medical Genomics. 7/5/2014
Bruna De Felice, Anna Annunziata, Giuseppe Fiorentino, Francesco Manfellotto, Raffaella D’Alessandro, Rita Marino, Marco Borra, Elio Biffali. Telomerase expression in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) patients. Journal of Human Genetics. Decision on JHG-14-099R1 17/7/2014
Bruna De Felice, Anna Annunziata, Giuseppe Fiorentino, Marco Borra, Elio Biffali, Cinzia Coppola, Roberto Cotrufo, Johannes Brettschneider, Maria Luisa Giordana, Marco Guida, Tamas Dalmay, Guy Wheeler, Raffaella D’Alessandro. Mir-338-3p is over-expressed in blood, CFS, serum and spinal cord from sporadic Amyotrophic Lateral Sclerosis patients. Neurogenetics. Ms. No. NEGE-D-14-00051R2 11/8/2014
