Ricercatore
Stazione Zoologica Anton Dohrn
Villa Comunale 80121 Napoli - Italia
Dipartimento Infrastrutture di ricerca per le risorse biologiche marine (RIMAR)
e-mail:roberta.piredda(at)szn.it
Interessi di ricerca
Le mie linee di ricerca si concentrano principalmente sull'utilizzo di approcci molecolari DNA barcoding e metabarcoding per lo studio della biodiversità. L’ applicazione del DNA ambientale (eDNA) viene utilizzato per esplorare le dinamiche delle comunità marine, dai batteri ai metazoi, su scala spaziale e temporale, anche con l'integrazione di parametri ambientali, dati morfologici, funzionali e geografici. I miei interessi includono l'uso di approcci molecolari per la tracciabilità e l'identificazione di pesci anche in prodotti ittici complessi e lo studio e l'uso del microbioma ospite ittico anche come strumento per tracciare l'origine geografica. Le mie competenze includono la generazione di pipeline per analisi ecologiche di metabarcoding di organismi eucariotici e procariotici, reti ecologiche, cura di database di riferimento di codici a barre, progettazione e test in silico di coppie di primer, approcci evolutivi con generazione di alberi filogenetici e reti di aplotipi.
Principali Pubblicazioni
Cardoni, S., Piredda, R., Grimm, G. W., Santorsola, M., Schulze, E. D., Denk, T., ... & Simeone, M. C. (2025). Pruning the Tree: Comparing OTUs and ASVs in High‐Throughput Sequencing of 5S‐IGS Nuclear Ribosomal DNA in Phylogenetic Studies. Ecology and Evolution, 15(10), e72242.
Di Capua, I., Luise, F., Zampicinini, G., Roncalli, V., Carotenuto, Y., & Piredda, R. (2024). Integrative approach to monitoring metazoan diversity and distribution in two Mediterranean coastal sites through morphology and organismal eDNA. Scientific Reports, 14(1), 19291.
Lorusso, L., Piredda, R., Mottola, A., Intermite, C., Ranieri, L., Carpino, S., & Di Pinto, A. (2024). Authentication of seafood species on the ASFIS list (FAO) by in-silico evaluation of primers for metabarcoding. Food Control, 110663.
Piredda, R., Mottola, A., Lorusso, L., Ranieri, L., Catanese, G., Cipriano, G., ... & Di Pinto, A. (2023). Microbiome-based study in wild-caught Scomber scombrus fish products at the end of the supply chain. LWT, 186, 115264.
Quero, G. M., Piredda, R., Basili, M., Maricchiolo, G., Mirto, S., Manini, E., ... & Luna, G. M. (2023). Host-associated and environmental microbiomes in an open-sea mediterranean gilthead sea bream fish farm. Microbial Ecology, 86(2), 1319-1330. (First co-author)
Pascoal, F., Tomasino, M. P., Piredda, R., Quero, G. M., Torgo, L., Poulain, J., ... & Magalhães, C. (2023). Inter-comparison of marine microbiome sampling protocols. ISME communications, 3(1), 84.
Piredda, R., Mottola, A., Cipriano, G., Carlucci, R., Ciccarese, G., & Di Pinto, A. (2022). Next Generation Sequencing (NGS) approach applied to species identification in mixed processed seafood products. Food Control, 133, 108590.
Di Capua, I., Piredda, R., Mazzocchi, M. G., & Zingone, A. (2021). Metazoan diversity and seasonality through eDNA metabarcoding at a Mediterranean long-term ecological research site. ICES Journal of Marine Science, 78(9), 3303-3316. (First co-author)
Minicante, S. A., Piredda, R., Quero, G. M., Finotto, S., Aubry, F. B., Bastianini, M., ... & Zingone, A. (2019). Habitat heterogeneity and connectivity: effects on the planktonic protist community structure at two adjacent coastal sites (the Lagoon and the Gulf of Venice, Northern Adriatic Sea, Italy) revealed by metabarcoding. Frontiers in microbiology, 10, 2736. (First co-author)
Piredda, R., Claverie, J. M., Decelle, J., De Vargas, C., Dunthorn, M., Edvardsen, B., ... & Massana, R. (2018). Diatom diversity through HTS-metabarcoding in coastal European seas. Scientific reports, 8(1), 18059.
