Giuseppina Barsacchi

Dipartimento di Biologia
Università di Pisa

Ferdinando Boero

Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biologiche e Ambientali
Università del Salento, Lecce

Gary G. Borisy

Director Marine Biological Laboratory (MBL)
Woods Hole, Mass. Usa

Peter Bukill

Director of the Sir Alister Hardy Foundation for Ocean Sciences and professor of Ocean Science, University of Plymouth, Plymoth, UK

Rita R. Colwell

Professor at University of Maryland College Park and at Johns Hopkins University Bloomberg School of Public Health Environmental Health Sciences, Center for Water and Health
Baltimore, MD, USA

Paul K. Dayton

Integrative Oceanography Division
Scripps Institution of Oceanography
University of California
San Dego, La jolla, CA, USA

Carlos Duarte

Director Instituto Mediterraneo de Estudio Avanzados
Mallorca, Illes Balears, SPAIN

Aldo Fasolo

Dipartimento di Biologia Animale e dell’uomo
Università di Torino

Richard Timothy Hunt – Premio Nobel per la Medicina 2001

London Research Institute, Clare Hall Laboratories
London, UK

Thomas Kiørboe

Professor, Technical University of Denmark
Danish Institute for Fisheries Research
Afd. for Havøkologi og Akvakultur, Kavalergården 6
Charlottenlund, DENMARK

Iain Mattaj

Director General European Molecular Biology Laboratory EMBL
Heidelberg, GERMANY

Christiane Nüsslein-Volhard - Premio Nobel per la Medicina 1995

Director of Dept. of Genetics
Max Planck Institute for Developmental Biology
Tübingen, GERMANY

Noriyuki Satoh

Department of Zoology, Kyoto University
Kyoto, JAPAN

Torsten Wiesel – Premio Nobel per la Medicina 1981

Vincent and Brooke Astor Professor Emeritus and President Emeritus
The Rockefeller University, Laboratory of Neurobiology
New York, NY, USA

Giuseppina Barsacchi

Dipartimento di Biologia
Università di Pisa
via G. Carducci, 13
56010 Ghezzano (Pisa) - Italia

Peter Burkill 

Marine Institute
Plymouth University
Drake Circus
Plymouth PL4 8AA - United Kingdom

Curriculum Vitae

Rita R. Colwell

Center for Bioinformatics and Computational Biology
University of Maryland
296 Biomolecular Sciences Bldg.
Room 3103
College Park, MD 20742 - USA

Roberto Danovaro

Dipartimento Scienze del Mare
Università Politecnica delle Marche
Via Brecce Bianche
60131 Ancona - Italia

Aldo Fasolo

Dipartimento di Biologia Animale e dell’Uomo
Università di Torino
Via Accademia Albertina, 13
10123 Torino - Italia

Bernard Kloareg

Station Biologique Roscoff
Place Georges Teissier - BP74
29682 Roscoff Cedex - France

Noriyuki Satoh

Marine Genomics Unit
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son
Kunigami-gun
904-0495 - Japan

Sommario

Ocean Medicines rappresenta una rete di centri di ricerca accademici e piccole e medie imprese di tutta Europa, con comprovata esperienza nei settori dell’alta istruzione e della formazione, allo stato attuale, altresì dotato di competenze e infrastrutture scientifiche e tecniche. L'obiettivo è di creare una rete di collaborazione e di scambio di conoscenze tra i partner industriali e accademici al fine di sviluppare molecole con attività antitumorali o anti-infettive già identificati dal consorzio a partire da microrganismi marini. Per raggiungere questo obiettivo sarà istituito un programma di mobilità per creare una nuova generazione di ricercatori nel campo della biologia marina, che saranno formati sulle tecniche di isolamento di composti da bioattivi a partire da batteri/microalghe e sul come ottimizzare la loro produzione attraverso scale-up semi-industriali per ulteriori sviluppi e test di tossicità a livello pre-clinico. Il programma Ocean Medicines considera anche le attività di commercializzazione, innovazione e imprenditorialità, tra cui fornire gli strumenti formativi sul come iniziare una nuova attività e come favorire una carriera industriale a ricercatori distaccati. La creazione di questa rete di ricerca internazionale, con i suoi effetti sinergici, contribuirà in modo significativo a condurre Istituti / PMI a livelli di formazione avanzata nel campo della scoperta di nuovi farmaci dal mare.

Cosa facciamo

SZN è coinvolto nel WP2 che riguarda specie di batteri e microalghe che producono metaboliti bioattivi con attività antitumorali/antinfettive; queste specie saranno sottoposte a coltivazione massiva in diverse condizioni di luce / temperatura / pH per ottimizzare la produzione dei metaboliti attivi. Estratti e frazioni saranno ulteriormente esaminati e analizzati chimicamente dagli altri partner.

Partners

SZN, IBP-CNR, SeaLife Pharma, eCoast, Epi-C, UiT, UNIABDN, MEDINA, UWC

Area di Ricerca

Biotecnologie Marine

Ruolo della SZN

Partner

Principal Investigator

Adrianna Ianora

Project Manager

Donatella De Pascale

Durata del progetto

December 2015 - December 2019

Istituzioni finanzianti

Commissione Europea, Settimo Programma Quadro

Personale coinvolto

Adrianna Ianora, Principal investigator
Giovanna Romano, Ricercatore Esperto

Sommario

Questo progetto mira a raccogliere campioni al South Shetland Trough (SST), vicino alla penisola antartica, una delle poche criogenici trincee d'altura in tutto il mondo.
Il PharmaDeep specifica di obiettivi sono:
(A) Raccogliere organismi marini provenienti da habitat di acqua fredda-profonda e che possono essere fonti uniche di prodotti naturali per il trattamento del cancro e delle malattie infettive.
(B) Eseguire la prima indagine biologica marina dell’habitat unico, la SST.
(C) Confrontare e contrapporre la fauna SST e i fattori che influenzano la distribuzione con altri ecosistemi simili.
(D) Studiare le interazioni di estreme condizioni fisiche e chimiche per valutare l'abitabilità di altri spazi planetari.

Cosa facciamo

La SZN sarà principalmente coinvolta nel campionamento di organismi zooplanctonici e fitoplanctonici per successiva identificazione tassonomica, screening di bioattività e analisi chimiche.

Partners

SZN, IBP-CNR, University of Aberdeen, Universitat de Barcelona, Insituto Español de Oceanografía, BioBridge, University of Chile, Nicolaus Copernicus University, Edinburgh University

Area di Ricerca

Biotecnologie Marine

Ruolo della SZN

Partner

Principal Investigator

Adrianna Ianora

Project Manager

Alan Jamieson

Durata del progetto

Ottobre 2015 - Giugno 2016

Istituzioni finanzianti

European Commission, under the EU EUROFLEETS2 program grant agreement n° 312762

Personale coinvolto

Adrianna Ianora, Principal investigator
Chiara Lauritano, Post-doc
Christian Galasso, PhD Student

Sommario

Il progetto PharmaSea è focalizzato sulla ricerca delle biotecnologie marine, sviluppo e commercializzazione di prodotti biotecnologici, inoltre ha l’obiettivo di unire ricercatori e specialisti di settori interdisciplinari, sia accademici che industriali, al fine di ricercare nuovi prodotti per tre settori di mercato: salute (infezioni, infiammazione, malattie neurodegenerative), cosmesi e nutrizione. Nonostante l'enorme potenziale delle biotecnologie marine, lo sfruttamento, in particolare a scala commerciale, è stata ostacolato da una serie di vincoli. Questi riguardano l'accesso (fisico e legale), la genetica degli organismi, isolamento dei composti, delucidazione delle strutture chimiche e validazione affidabile precoce dell’attività biologica di tali composti. PharmaSea si pone come obiettivo di risolvere tali problematiche. Nell’ambito del progetto sarà analizzata un’ampia varietà genetica compreso collezioni di  microorganismi marini possedute da alcuni partners e nuove collezioni di ceppi campionati in condizioni ambientali estreme (e.g. siti marini profondi, caldi e freddi) per produrre nuovi composti con caratteristiche appropriate per lo sviluppo da parte delle SME. L'obiettivo globale di PharmaSea è produrre due composti ad ampia scala e promuoverli nelle valutazioni pre-cliniche.

Cosa facciamo

La SZN sarà principalmente coinvolta nel campionamento di organismi zooplanctonici e fitoplanctonici per successiva identificazione tassonomica, screening di bioattività e analisi chimiche.

Partners

SZN, Katholieke Universiteit Leuven, The University Court of the University of Aberdeen, MarBio, eCoast, Biodridge, MEDINA, University college Cork, BIOCOM, CNR, Universidade de Santiago de Compostela, The Royal society of chemistry, C-LECTA GMBH, Denmarks Tekniske Universitet, DEEPTEK, Advanced chemistry development UK, Wuhan University, Institute of Microbiology Chinese Academy of Sciences, University of the Western Cape, Instituto de Dinamica Celular y Biotecnologia, Asociacion Instituto Nacional de Biodiversidad, Union Internationale pour la conservation de la nature et de ses ressources, University of Waikato, SeaLifePharma.

Area di Ricerca

Biotecnologie Marine

Ruolo della SZN

Partner

Principal Investigator

Adrianna Ianora

Project Manager

Peter de Witte

Durata del progetto

Ottobre 2012 - Ottobre 2016

Istituzioni finanzianti

European Commission, under the 7th Framework Programme (FP7/2007-2013 under grant agreement n° 312184)

Personale coinvolto

Adrianna Ianora, Principal investigator
Giovanna Romano, Experienced Researcher
Francesco Esposito, Technologist
Chiara Lauritano, Post-doc

Struttura Organizzativa della SZN, come da Regolamento di Organizzazione e Funzionamento, approvata con delibera del Consiglio di Amministrazione n. 142 del 17/11/2020. 

Versione cliccabile

PON01_02782 Nuove strategie nanotecnologiche per la messa a punto di farmaci e presidi diagnostici diretti verso cellule cancerose circolanti (CTC)

Capofila

Biogem S.c.a r.l.

Durata

36 mesi

Parole chiave

CTC, antitumorale, microalghe

ERC sectors

LS7_3, LS9_9

Sintesi del progetto

La presenza di cellule tumorali circolanti (CTC) nel sangue è associata ad uno stadio di malattia avanzato e ad
una ridotta sopravvivenza dei pazienti oncologici. La conoscenza delle caratteristiche delle CTC riveste quindi un’importanza fondamentale per molte applicazioni di interesse clinico. Questo progetto si propone di isolare CTC dal sangue di pazienti affetti da tumori epiteliali ed ematologici, di sviluppare protocolli per l'espansione ex-vivo di queste cellule e di effettuare una caratterizzazione molecolare completa al fine di definirne in maniera chiara i profili mutazionali e trascrizionali. Ci si propone di sviluppare kit diagnostici nonché di identificare nuovi bersagli molecolari che potranno essere bersaglio di strumenti terapeutici innovativi per il trattamento mirato del cancro. Il progetto prevede inoltre una fase in cui si provvederà all'identificazione di molecole con attività anti-tumorale nei confronti delle CTC, mediante screening di librerie di composti, sostanze naturali e peptidi incluso prodotti naturali derivanti da fonti innovative quali le microalghe marine.

Descrizione delle attività

Le attività previste dal progetto sono articolate in 6 obiettivi realizzativi (O.R.).
O.R. 1 Sviluppo di dispositivi nanotecnologici per l’isolamento di cellule tumorali circolanti (CTC)
O.R.2 Caratterizzazione molecolare di CTC: identificazione di target molecolari
O.R.3 Caratterizzazione molecolare di CTC: messa a punto di presidi diagnostici avanzati
O.R.4 Sviluppo di modelli murini per la caratterizzazione di CTC    
O.R. 5 Sviluppo di nuove procedure tecnologiche per il targeting di CTC e per l’ottimizzazione del
delivery di farmaci e/o molecole ad attività antitumorale
O.R. 6 Targeting molecolare di CTC
La Stazione Zoologica è coinvolta nella seguente attività:
Attività 6.2 Identificazione di molecole naturali e/o di sintesi con possibile attività biologica sulle CTC
L’obiettivo principale dell’attività è quello di fornire estratti e frazioni da microalghe marine coltivabili con proprietà antitumorali. Il focus dell’attività è l’identificazione di estratti contenenti sostanze antitumorali e l’isolamento e caratterizzazione di tali composti attraverso un sistema di screening basato su saggi biologici su frazioni ottenute da estratti  grezzi. Infine ci si propone di ottenere i composti bioattivi di interesse attraverso colture su larga scala del microrganismo produttore.

Risultati attesi

Identificazione di almeno una piccolo molecola con attività antitumorale su CTC.

Time chart

Tab 1 Costi

Tab 2 Personale SZN

PON01_00117 Antigeni e Adiuvanti per Vaccini e Immunoterapia

Capofila

Novartis Vaccines & Diagnostics srl

Durata

36 mesi

Parole chiave

Biotecnologie, salute umana, microalghe

ERC sectors

LS7_3, LS6_11, LS7_9

Sintesi del progetto

I benefici terapeutici di una stimolazione del sistema immunitario innato sono ampiamente documentati. Molte sostanze di origine naturale, comprese alcune molecole lipidiche o glicolipidiche sono capaci di stimolare vari componenti cellulari del sistema immunitario innato. Pertanto metaboliti a basso peso molecolare o componenti lipidici di estratti di microorganismi marini eucariotici potrebbero  avere proprietà stimolanti su cellule immunitarie innate e agire come adiuvanti o immunomodulatori.
L’approccio innovativo proposto in questo progetto si basa su un partenariato pubblico-privato di assoluta avanguardia e appartenente in maniera prevalente ad Aree di Convergenza (Sicilia, Calabria e Campania).
Il progetto si prefigge di raggiungere tre importanti traguardi: 1. Lo sviluppo di vaccini innovativi per infezioni batteriche e virali 2. La messa a punto di nuove molecole ad azione adiuvante e lo studio del meccanismo di azione di quelle già utilizzate 3. Lo sviluppo di nuovi vettori virali più efficaci e sicuri per la realizzazione di nuovi vaccini.
Il ruolo della Stazione Zoologica nel progetto è quello di identificare e coltivare specie di microalghe marine che mostrano attività come vaccini o adiuvanti.

Descrizione delle attività

Il progetto si articolerà lungo i seguenti Obiettivi Realizzativi (OR):
OR 1. Identificazione di candidati antigenici per lo sviluppo di potenziali vaccini contro Streptococcus pneumoniae, Clostridium difficile, Escherichia coli patogeni, HCMV
OR 2. Identificazione di nuovi adiuvanti ed analisi del meccanismo di azione di adiuvanti conosciuti
OR 3. Identificazione e validazione di nuovi vettori Adenovirus e MVA e Virus Like Particles da utilizzare come potenziali vaccini contro malattie infettive (HCMV, Malaria, Influenza, RSV, etc)
La Stazione Zoologica partecipa all’attività 2.1  
Attività 2.1. Identificazione di nuovi composti naturali con attività immunomodulante e adiuvante da microalghe marine
ed in particolare alla sub-attività:
RI 2.1.1. Preparazione di estratti e frazioni da microalghe, isolamento ed identificazione delle sostanze con proprietà immunoregolatrici.
Poiché è già dimostrato che gli estratti di organismi marini contengono sostanze immunoregolatrici (per esempio l’alfa galoctoside ceramide, capace di stimolare le cellule NKT) e lipidi diversi da quelli presenti nell’uomo, lo studio proposto in questo progetto mira non solo ad identificare nuove molecole in grado di interagire con il sistema immunitario, ma anche ad individuare composti per formulazioni terapeutiche, ad esempio come composti adiuvanti per vaccini.  A tal scopo il gruppo della dr. Ianora preparerà pellet di microalghe per l’isolamento e l’identificazione delle sostanze con proprietà immunoregolatrici potenzialmente presenti. Le frazioni verranno saggiate per la loro capacità di attivazione di varie cellule e recettori del sistema immunitario innato. Lo studio verrà effettuato in collaborazione con IBB-CNR (terzo affidatario SZN) farà da supporto alla caratterizzazione dei vari componenti attivi mediante l’uso di tecniche di NMR.

Time chart

Risultati attesi

Ottenimento di almeno un nuovo composto naturale con attività immunostimolante e adiuvante derivato da microalghe marine.

Tab 1 Costi

Tab 2 Personale SZN

PON01_02093 Studio di nuove tecnologie e piattaforme tecnologiche per il miglioramento di processi produttivi di principi attivi farmaceutici di interesse industriale e ricerca di nuove molecole bioattive da sorgenti naturali

Capofila

Sanofi-Aventis S.p.A.

Durata

36 mesi

Parole chiave

farmaci naturali, chemioterapici, microalghe

ERC sectors

LS7_3, LS9_9

Sintesi del progetto

L’obiettivo generale del progetto è lo studio e l’applicazione di tecnologie avanzate ed innovative nel miglioramento di processi produttivi di sostanze attive di interesse industriale nel settore farmaceutico e la ricerca di nuove molecole dotate di potenziale attività farmacologica nel settore degli antinfettivi, anti- tumorali e anti-infiammatori.
Da un lato il progetto quindi approfondirà gli aspetti più innovativi delle tecnologie della microbiologia e genetica di ceppi produttori.
Dall’altro studierà la possibilità di individuare nuovi prodotti quali candidati di potenziale interesse farmaceutico nel campo della cura delle malattie infettive ma non solo. Tali attività saranno focalizzate sulla ricerca di nuove sostanze di interesse farmacologico tramite screening di estratti da microrganismi e/o da organismi acquatici e caratterizzazione delle loro proprietà benefiche e antinfettive.
Questo obiettivo sarà perseguito attraverso una stretta collaborazione con centri di ricerca di eccellenza sia accademici che privati che con le loro competenze possono efficacemente integrare le capacità di innovazione della società.

Descrizione delle attività

Il progetto si articola in due linee, ognuna suddivisa in 4 obiettivi realizzativi (OR) secondo il seguente schema:
OR 1.1 - Miglioramento Genetico /Tecnologie genomiche
OR 1.2 - Miglioramento Genetico /Strain improvement
OR 1.3 - Fisiologia delle fermentazioni
OR 1.4 - Estrazione/Purificazione
OR 2.1 - Nuove metodologie per la ricerca di molecole bioattive da microrganismi
OR 2.2 - Sintesi di derivati chimici di prodotti maturi
OR 2.3 - Individuazione di target e composti naturali rilevanti per le malattie tumorali, e cronico-degenerative legate all’invecchiamento
OR 2.4 - Screening e caratterizzazione di estratti da organismi marini
La Stazione Zoologica sarà coinvolta nella seguente attività:
OR 2.4 - Screening e caratterizzazione di estratti da organismi marini
Lo scopo di questo Obiettivo Realizzativo è l’identificazione di nuovi principi attivi con azione antimicrobica e/o antitumorale e/o protettive nei confronti della neuro degenerazione e/o invecchiamento. Per il raggiungimento di questo obiettivo La Stazione Zoologica svolgerà le seguenti attività:
ARI 2.4.1 - Individuazione degli organismi da cui estrarre principi attivi e loro raccolta
Verranno identificate microalghe già note che possano costituire una fonte di principi attivi con attività antimicrobica, antitumorale, antineurodegenerativa, antinvecchiamento. La selezione verrà effettuata sulla base alla loro attività ecologica.
ARI 2.4.2 - Estrazione e preparazione dei campioni
Ogni specie di microalga verrà coltivata alla SZN in modo da ottenere una biomassa sufficiente per l’estrazione di piccole molecole da parte dell’Istituto del CNR di Chimica Biomolecolare (ICB-CNR) in qualità di terzo affidatario.. Una volta identificate le frazioni attive dagli altri partner si procederà all’identificazione chimica delle molecole da parte del ICB e la produzione presso la SZN delle alghe che producono tali molecole.

Risultati attesi

Identificazione di almeno un prodotto che presenti le caratteristiche per essere valutato come nuovo "Lead candidate" (Nuovo prodotto).

Time chart

Tab 1 Costi

Tab 2 Personale SZN

COCONET - Towards COast to COast NETworks of marine protected areas (from the shore to the high and deep sea), coupled with sea-based wind energy potential

Sommario

Il progetto identificherà gruppi di zone marine protette putativamente interconnessi nel Mediterraneo e nel Mar Nero, su scala locale (singolo MPA) regionale (reti di AMP) e di bacino (rete di reti). L'individuazione delle connessioni fisiche e biologiche aiuterà a chiarire i processi che governano i modelli di distribuzione della biodiversità . Ciò permetterà di migliorare politiche di gestione ambientale efficace, anche per accertare se le AMP esistenti sono sufficienti per il networking ecologico e di suggerire come progettare ulteriori schemi di protezione basati su scambi effettivi tra le aree protette. Il focus costiero sarà ampliato a quello offshore ed agli habitat di acque profonde, comprendendoli nelle reti di AMP. Studi socioeconomici integreranno la gestione ambientale mirando sia alla tutela dell'ambiente (AMP) che alla produzione di energia pulita (OFW). Le legislazioni attuali sono fondamentali per fornire le linee guida per trovare soluzioni giuridiche ai problemi sull'uso dello spazio marittimo. Saranno condotti due progetti pilota, uno nel Mediterraneo ed uno nel Mar Nero.

Ruolo SZN

SZN lavora come sub-partner del CONISMA ed è responsabile dello studio della diversità genetica e connettività nei due progetti pilota nelle due specie di fanerogame marine, Posidonia oceanica e Zostera noltei.

Partners

3e, Belgium; Clu, Italy; Cnr-Ismar, Italy; Cnrs, France; Coispa, Italy; Conisma, Italy; Csic, Spain; Dtu Aqua, Denmark; Geoecomar, Romania; Hcmr-Ioo, Greece; Iber-Bas, Bulgaria; Ibmk, Montenegro; Ibss Nasu, Ukraine; Ieo, Spain; Ih Cantabria, Spain; Inat, Tunisia; Io-Bas, Bulgaria; Iolr, Israel; Israbat, Morocco; Istanbul University, Turkey; Metu, Turkey; Mhi, Ukraine; Naturebureau, Uk; Nea, Georgia; Nenuphar, France; Nersc, Norway; Nimrd, Romania; Obibss, Ukraine; Rshu, Russia; Sinop University, Turkey; Sio Ras, Russia; Ukrsces, Ukraine; University Of Malta, Malta; University Of Rostock, Germany; University Of The Aegean, Greece; University Of Zadar, Croatia; Unizkm, Albania; Usof, Bulgaria; Ustv, France.

Durata

2012-2015

P. I.

Gabriele Procaccini
Coordinatore del progetto: Ferdinando Boero (University of Salento, Italy)

Istituzione finanziatrice

EU, FP7-KBBE

Contributo alla SZN

€ 47,506.65

Website

http://www.coconet-fp7.eu